Glossaire du blob : tous les termes expliqués

A

Actine : Protéine filamenteuse présente dans toutes les cellules eucaryotes. Chez le blob, les filaments d'actine forment le "squelette" interne des tubes du réseau veineux et participent aux oscillations qui permettent la circulation du cytoplasme. Associée à la myosine, elle forme le moteur actomyosine.

Actomyosine : Complexe formé par l'actine et la myosine. C'est le moteur moléculaire qui génère les contractions rythmiques du cytoplasme du blob (environ 100 secondes par cycle), permettant sa locomotion et la circulation des nutriments dans le réseau.

Amiboïde (mouvement) : Mode de déplacement qui consiste à émettre des extensions temporaires (pseudopodes) et à y faire affluer le cytoplasme. C'est le mode de déplacement du blob, partagé avec les amibes et les globules blancs humains.

Amoebozoa : Groupe d'eucaryotes unicellulaires incluant les amibes et les myxomycètes. C'est le groupe dans lequel le blob a été reclassé dans les années 1990, après les analyses moléculaires. Pronunciation : "a-mé-bo-zo-a".

C

Coenocyte (prononcé "sé-no-si-te") : Cellule géante contenant de nombreux noyaux dans un cytoplasme commun, sans cloisons internes entre les noyaux. Le blob (plasmode) est un coenocyte : tous ses noyaux partagent le même cytoplasme. Contraire : cellule "cloisonnée" (comme dans la plupart des organismes pluricellulaires).

Cytoplasme : Contenu liquide d'une cellule, à l'exclusion du noyau. Chez le blob, le cytoplasme circule librement dans tout le réseau veineux, transportant nutriments, signaux chimiques et noyaux. Sa fluidité variable (états sol et gel) est à la base du déplacement du blob.

E

Eucaryote : Organisme dont les cellules possèdent un noyau délimité par une membrane. Le blob est un eucaryote (comme les animaux, les plantes et les champignons), contrairement aux bactéries (procaryotes) qui n'ont pas de noyau délimité.

G

Gélose agar : Substrat gélifié préparé à partir d'agar (un polysaccharide extrait d'algues rouges), utilisé en laboratoire comme support nutritif ou comme substrat pour élever le blob. La gélose à 2% (20g d'agar pour 1L d'eau) est la concentration standard pour le blob. Avantage sur le papier absorbant : plus stable, moins susceptible de moisir.

H

Habituation : Forme d'apprentissage qui consiste à réduire progressivement sa réponse à un stimulus répété, une fois qu'on a "appris" que ce stimulus est sans danger. Le blob est capable d'habituation (démontré par Dussutour, 2016) : il apprend à traverser des substances répulsives (sel, caféine) après plusieurs jours d'exposition. C'est la première preuve d'habituation chez un organisme unicellulaire.

M

matA : Gène qui contrôle la compatibilité reproductrice chez Physarum polycephalum. C'est l'un des trois gènes du système, avec matB et matC. Il existe sous 16 versions connues, et la combinaison des trois gènes (16 × 15 × 3) donne au blob ses 720 types sexuels. C'est matA qui décide si l'union de deux cellules donnera un nouveau plasmode.

Méiose : Division cellulaire qui réduit le nombre de chromosomes de moitié. La méiose se produit lors de la sporulation du blob : les cellules résultantes (spores) sont haploïdes (un seul exemplaire de chaque chromosome) et germent pour donner des myxamoebas.

Myxamoeba : Stade unicellulaire, mobile et haploïde du cycle de vie du blob. Les myxamoebas résultent de la germination des spores. Elles doivent trouver une autre myxamoeba d'un type sexuel compatible pour fusionner et donner un plasmode diploïde.

Myxomycète (prononcé "mik-so-mi-sè-te") : Nom scientifique du groupe auquel appartient le blob. Du grec myxa (mucus) et mykês (champignon). Le terme évoque leur aspect visqueux et leur ancienne classification parmi les champignons, avant leur reclassification dans les protistes.

P

Phagocytose (prononcé "fa-go-si-to-ze") : Mode d'alimentation par ingestion de particules entières, en les enveloppant dans la membrane cellulaire. C'est ainsi que le blob mange : il englobe des bactéries, des spores ou des fragments de nourriture dans sa membrane, les emprisonne dans une vésicule (phagosome) et les digère avec des enzymes. Les globules blancs humains utilisent le même mécanisme.

Plasmalemme : Membrane externe du blob (ce qu'on appelle plus généralement membrane plasmique). C'est la seule membrane qui sépare l'intérieur du blob de l'extérieur. Souple et déformable, elle permet la phagocytose et le déplacement par pseudopodes.

Plasmode : Nom scientifique du blob en phase active (le grand réseau veineux jaune). C'est la forme la plus connue du blob : une masse de cytoplasme plurinucléée et mobile, capable d'explorer son environnement, de se nourrir et de résoudre des problèmes. Contraire : sclérote (forme dormante).

Protiste : Terme informel désignant les organismes eucaryotes qui n'appartiennent ni aux animaux, ni aux plantes, ni aux champignons. Le blob est un protiste. Le groupe est très hétérogène et n'est plus considéré comme un groupe naturel ("clade") dans la classification moderne.

Pseudopode (prononcé "pséu-do-po-de") : Extension temporaire de la cellule, formée par un afflux de cytoplasme vers un point de la membrane. Les pseudopodes permettent la phagocytose et le déplacement chez les amibes et le blob. Du grec pseudos (faux) et pous (pied) : "faux pied".

S

Sclérote (prononcé "sklé-ro-te") : Forme de dormance du blob : une masse compacte et déshydratée, avec une enveloppe protectrice. Le sclérote peut survivre pendant des années dans cet état. Du grec sklêros (dur). Il se réactive en quelques heures au contact de l'humidité.

Sporange : Petite structure dressée, brune, que le blob forme lors de la sporulation (reproduction sexuée). Chaque sporange contient des milliers de spores. En séchant, le sporange s'ouvre et libère les spores dans l'air.

Sporulation : Processus par lequel le blob entre en reproduction sexuée : le plasmode actif se transforme progressivement en sporanges contenant des spores. Déclenché par des conditions défavorables prolongées (manque de nourriture, sécheresse). La méiose se produit durant ce processus.

Z

Zygote : Cellule résultant de la fusion de deux myxamoebas compatibles lors de la reproduction sexuée du blob. Le zygote est diploïde (deux exemplaires de chaque chromosome) et va se diviser de nombreuses fois sans cytocinèse (sans séparer les cellules filles), formant progressivement le plasmode plurinucléé.

Les faux amis du vocabulaire courant

Quatre mots employés partout à propos du blob n'ont pas, en biologie, le sens qu'on leur prête dans le langage ordinaire. Les confondre suffit à rendre incompréhensible la moitié de la littérature.

Intelligence. En éthologie, le mot désigne une capacité à adapter son comportement à un problème nouveau. Il n'implique ni conscience, ni intention, ni représentation mentale. Dire que le blob est intelligent au sens biologique est défendable ; le dire au sens courant ne l'est pas. Voir l'intelligence distribuée.

Mémoire. Ici, c'est une modification durable du comportement à la suite d'une expérience. Aucun stockage symbolique n'est en jeu. Le blob « se souvient » comme un ressort garde une déformation, pas comme un carnet garde une note.

Décider. Le terme décrit le fait qu'une des options possibles l'emporte à l'issue d'un processus. Chez le blob, c'est une compétition physique entre veines, pas une délibération.

Moisissure. Le nom anglais slime mold et le français « moisissure visqueuse » induisent en erreur : le blob n'est pas un champignon et n'a aucun lien de parenté avec les moisissures. La différence est détaillée dans blob et champignons.

Les termes que vous croiserez dans les publications

Actomyosine

Complexe protéique associant actine et myosine, moteur des contractions qui font circuler le cytoplasme. C'est le même couple de protéines que dans nos muscles.

Shuttle streaming

Nom anglais du flux cytoplasmique alternatif du blob, qui change de sens toutes les 100 à 120 secondes environ.

Habituation

Diminution progressive de la réponse à un stimulus répété et sans conséquence. C'est la forme d'apprentissage démontrée chez le blob en 2016.

Chimiotaxie

Déplacement orienté par un gradient de concentration chimique. Positive vers la nourriture, négative face au sel ou à la quinine.

Photophobie

Fuite active de la lumière. Chez le blob, elle est mesurable et sert de levier pour orienter sa croissance en élevage.

Sporocarpe

Structure de fructification dressée qui produit et libère les spores, formée quand les conditions deviennent défavorables.

Myxamibe

Cellule amiboïde issue de la germination d'une spore, stade unicellulaire à noyau unique qui précède le plasmode.